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Available online 29 August 2025
Does human microbiota interact with immunosuppressive treatment of systemic autoimmune rheumatological diseases? A systematic review
¿Interacciona la microbiota humana con el tratamiento inmunosupresor de las enfermedades reumatológicas autoinmunes sistémicas? Revisión sistemática
Noemí Franco-Domingoa,
, Patricia Saiz-Lópezb, Loreto Carmona-Ortellsc
a Hospital Universitario Severo Ochoa, Leganés, Madrid, Spain
b Hospital Universitario de Burgos (HUBU), Burgos, Spain
c Instituto de Salud Musculoesquelética (INMUSC), Madrid, Spain
Received 01 March 2025. Accepted 20 June 2025
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Table 1. Microbiota prognostic factors studied in response to immunosuppressive treatment. Definition and measures used in the identified studies.
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Table 2. Table of evidence. Characteristics of the included studies.
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Table 3. Sample analysis and processing methods.
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Table 4. Parameters analysed in the studies.
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Abstract
Objective

To collect and analyse studies evaluating the interaction between the human microbiota (HM) and immunosuppressive (IS) treatments for systemic autoimmune rheumatological diseases (ARDs), and their impact on the disease.

Methods

A systematic review was performed based on an electronic search strategy in Medline, Embase, and Cochrane Library (inception-02/2024). We included papers studying the interaction of HM and IS treatments in adult patients with ARDs in which parameters of diversity and taxonomic composition were measured. We excluded spondyloarthritis for which more extensive knowledge is available. Studies of any language were allowed, prioritising clinical trials but also including observational longitudinal prospective and retrospective, and case-control studies.

Results

Of 2570 papers identified, 20 were included (15 from rheumatoid arthritis, 3 from systemic lupus erythematosus, 1 from primary Sjögren's syndrome and 1 from systemic sclerosis), overall, with a moderate risk of bias. The paucity of studies and niche specificity limited the study to the gut microbiota. A trend towards decreased diversity and compositional changes in gut microbiota and partial restitution in patients responding to IS treatment was identified. The heterogeneity observed in the design and outcome measures of the studies precluded a metaanalysis; however, the results point to a possible relationship between HM alterations and response to IS treatments in ARDs.

Conclusions

Available studies suggest a potential association between the HM and the response to IS therapies in ARDs. However, the overall moderate quality of evidence and substantial methodological heterogeneity limit the strength of combined conclusions. Standardization of microbiota-related studies is needed to enable data integration and support more robust inferences.

Keywords:
Connective tissue diseases
Rheumatoid arthritis
Systemic lupus erythematosus
Sjögren’s Syndrome
Systemic scleroderma
Microbiota
Dysbiosis
Treatment outcome
Precision medicine
Recurrence
Predictive value of tests
Drug therapy
Therapeutics
Resumen
Objetivo

Recopilar y analizar los estudios en que se evalúa la interacción entre la microbiota humana (MH) y los tratamientos inmunosupresores (IS) de las enfermedades reumatológicas autoinmunes sistémicas (ERAS), y su repercusión en la enfermedad.

Métodos

Se realizó una revisión sistemática basada en una estrategia de búsqueda electrónica en Medline, Embase y Cochrane Library (inicio-02/2024). Se incluyeron aquellos trabajos que estudiaban la interacción de la MH y el tratamiento IS en ERAS en pacientes adultos en que se midieran parámetros de diversidad y composición taxonómica. Se excluyeron las espondiloartritis por disponerse de un conocimiento más extenso. Se permitieron estudios de cualquier idioma, priorizándose los ensayos clínicos, pero incluyendo también estudios observacionales longitudinales prospectivos y retrospectivos, y casos y controles.

Resultados

De 2570 trabajos identificados, se incluyeron 20 (15 de artritis reumatoide, 3 de lupus eritematoso sistémico, 1 de síndrome de Sjögren primario y 1 de esclerosis sistémica), en general con un riesgo de sesgo moderado. La escasez de estudios y la especificidad de nicho limitó el estudio a la microbiota intestinal. Se identificó una tendencia a la disminución de diversidad y cambios en la composición en la microbiota y una restitución parcial en los pacientes respondedores a tratamiento IS. La heterogeneidad observada en el diseño y las medidas de resultado de los estudios impidió realizar un metaanálisis; no obstante, los resultados apuntan a una posible relación entre las alteraciones de la MH y la respuesta a los tratamientos IS en las ERAS.

Conclusiones

Los estudios disponibles sugieren una posible asociación entre la MH y la respuesta a terapias IS en ERAS. Sin embargo, la calidad global moderada de la evidencia y la alta heterogeneidad metodológica limitan la solidez de conclusiones combinadas. Es necesario la estandarización de los estudios sobre la MH para poder combinar resultados y establecer conclusiones con mayor confianza.

Palabras clave:
Enfermedades del tejido conectivo
Artritis reumatoide
Lupus eritematoso sistémico
Síndrome de Sjögren
Esclerosis sistémica
Microbiota
Disbiosis
Resultado del tratamiento
Medicina de precisión
Recurrencia
Valor predictivo de las pruebas
Terapia farmacológica
Terapéutica

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